Metrolab Blog

Ανάλυση SARS CoV-2 σε λύματα – Ποιος είναι ο ρόλος της δειγματοληψίας ? Part 1

Η πανδημία του κορονοϊού SARS CoV-2 ανέδειξε στο ευρύ κοινό τον τομέα της επιδημιολογίας λυμάτων , ένας τομέας αρκετά γνωστός στους επιστήμονες όπου πλέον διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στην ποιοτική και ποσοτική ανίχνευση του κορονοϊού . 

Ο συνεχής και τακτικός έλεγχος των λυμάτων για κορονοϊό SARS CoV-2 αλλά και για άλλα είδη ιών γνωστά που μπορούν να βρεθούν στα ανθρώπινα κόπρανα, μπορεί να αναδείξει σημαντικές πληροφορίες για την εξάπλωση του covid-19 στον ανθρώπινο πληθυσμό , την γεωγραφική κατανομή του και την τάση των ενεργών κρουσμάτων .

Αναλύσεις που απαιτούν εργαστηριακά μοριακό έλεγχο με τεχνολογία rt-PCR , με βασική προτεραιότητα όμως τη δειγματοληψία . Σε αυτό το άρθρο δεν θα δούμε τους κανόνες δειγματοληψίας και μεταφοράς δειγμάτων από ιούς , καθώς αυτοί διατυπώνονται ξεκάθαρα στο Standard Methods .

Σε ποιο σημείο θα γίνει η δειγματοληψία  ?

Η δειγματοληψία μπορεί να γίνει στην είσοδο του βιολογικού καθαρισμού της πόλης (ή επιχείρησης ή βιομηχανικού πάρκου) και στο δίκτυο αποχέτευσης σε κόμβους του δικτύου ή σε αντλιοστάσια λυμάτων . Δύο βασικά μέρη δειγματοληψίας όπου βέβαια μας αναδεικνύουν διαφορετική εικόνα για την εξάπλωση του covid-19 .

Η δειγματοληψία στην είσοδο του βιολογικού καθαρισμού αναδεικνύει την τάση εξάπλωσης για τον ισοδύναμο πληθυσμό που εξυπηρετεί η εγκατάσταση και βοηθάει στην έγκαιρη προειδοποίηση και εκτίμησης των κρουσμάτων . Σημαντικό να αναφερθεί πως τα δείγματα θα πρέπει να ληφθούν λαμβάνοντας γνώση τη λειτουργία της εγκατάστασης και τις ιδιαιτερότητες της εισόδου σε παραμέτρους όπως η παροχή ( ωριαία , ημερήσια ) , COD, BOD, TSS, TN , έτσι ώστε να αντιληφθούμε την ποιότητα του δείγματος που έχουμε.

Στο δίκτυο αποχέτευσης και στα φρεάτια-κόμβους αντλιοστασίων έχουμε τη δυνατότητα να αναπτύξουμε γεωγραφική κατανομή της εξάπλωσης και να αντιληφθούμε έγκαιρα σε συγκεκριμένα σημεία περιοχών ή εγκαταστάσεων την τάση εξάπλωσης  .

Οι δύο τύποι δειγματοληψίας είναι αξιόπιστοι «σύμμαχοι» στη συλλογή πληροφοριών της διασποράς του ιού από τις αρμόδιες αρχές .

Τι μας προβληματίζει στη συλλογή δειγμάτων ?

Η αποτελεσματική & αξιόπιστη εργαστηριακή ανάλυση λυμάτων του SARS CoV-2 απαιτεί προσεκτικά βήματα στη δειγματοληψία . Τα προβλήματα της δειγματοληψίας του λύματος είναι κοινά όπως και για τις υπόλοιπες αναλύσεις, εδώ όμως οφείλουμε να είμαστε περισσότερο υπεύθυνοι για να αποκτήσουμε αξιόπιστα και «στιβαρά» αποτελέσματα .

Τα προβλήματα που έχουμε είναι 1)σημείο δειγματοληψίας 2) συντήρηση δείγματος 3) ταυτοποίηση δείγματος και ασφάλεια .

Ανάλογα με τους δύο βασικούς χωρικούς άξονες δειγματοληψίας ( βιολογ.καθαρισμός ή δίκτυο), κάθε πρόβλημα αποκτά την δική του έκταση και σημασία . Αν θέλουμε να έχουμε αξιόπιστα δείγματα πρέπει να αναγνωρίσουμε τα προβλήματα, στην περίπτωση οργανωμένης εγκατάστασης βιολογικού καθαρισμού το σημείο της δειγματοληψίας χωρικά αλλά και χρονικά είναι σημαντικό , με την ασφάλεια αλλά και τη συντήρηση να μην είναι «πονοκέφαλος», πάντα σύμφωνα με τη νομοθεσία και το Standard Methods  . Το δίκτυο αποχέτευσης φέρει αρκετές προκλήσεις καθώς πρέπει να διασφαλίσουμε ότι θα αντιμετωπίσουμε τις ανωτέρω προκλήσεις αφού έχουμε σημεία απομακρυσμένα , με ελάχιστη ασφάλεια και ακεραιότητα δειγμάτων , και η συντήρηση του δείγματος είναι απαιτούμενο για την ανάλυση του covid-19 .

Σε εγκαταστάσεις βιολογικού καθαρισμού τα πράγματα είναι αρκετά εύκολα αλλά το σημείο δειγματοληψίας πρέπει να είναι σε θέση όπου το λύμα είναι αρκετά ομογενοποιημένο και όσο γίνεται αντικειμενικό της θέσης .

Στις περιπτώσεις δειγματοληψίας για διερεύνηση του Covid-19 στα λύματα αξίζει να αναφέρουμε πως η μετάδοση του ιού μέσω των λυμάτων στον άνθρωπο είναι ελάχιστη έως μηδενική , ωστόσο αν το δείγμα φέρει τον ιό και έχουμε σταγονίδια του λύματος ή αερόλυμα νερού-λύματος εξαιτίας της παροχής ή της θέσης τότε είναι πιθανή η μετάδοση του . Σε κάθε περίπτωση πρέπει να λαμβάνονται μέτρα για την ασφάλεια του προσωπικού.

Στο δίκτυο αποχέτευσης και τα φρεάτια αντλιοστασίων , η είσοδος του προσωπικού σε δύσκολα σημεία είναι απαραίτητη , και εκεί η μετάδοση του ιού στον άνθρωπο είναι ελάχιστη αλλά ωστόσο πιθανή καθώς οι εγκαταστάσεις είναι αρκετά μικρές και έχουμε πιθανότητα ο ιός να βρεθεί στον υπερκείμενο αέρα . Η προστασία και ο απαραίτητος εξοπλισμός του προσωπικού είναι υποχρεωτικός καθώς πρέπει να τηρηθούν και τα πρωτόκολλα ασφαλείας δειγματοληψίας σε φρεάτια .

Discover more from Metrolab Blog

Subscribe now to keep reading and get access to the full archive.

Continue reading